技能获取主要通过技能机器、隐藏道具、道馆奖励和特定NPC教授等途径实现。技能机器分布在游戏各个区域，例如龙爪可在冠军之路1层获取，水之波动通过击败华蓝市道馆馆主获得。冥想技能需要战胜金黄市道馆馆主，而吠叫技能机则位于月见山出口附近。部分技能如气合拳需在115号道路的流星瀑布入口左侧沙滩通过冲浪到达特定位置拾取，或利用拾荒特性精灵低概率获得。
红宝石藏在火烈山山洞内，蓝宝石需在获得游泳能力后潜入海底深处获取。岩山隧道内使用闪光术可找到教授山崩地裂的NPC，而彩虹市某房屋内的小女孩会赠送HM02飞翔技能。紫苑镇宝可梦塔6层被幽灵阻挡时，需先完成火箭队基地任务获取观测镜才能继续探索。部分技能如报恩和撒气，需在特定城镇的竹木屋中根据队伍首位精灵的亲密度高低与NPC对话获得。
岩石系道馆奖励TM39岩石封，草系道馆赠送TM19亿万吸收，电系道馆战胜马志士后获得TM34电磁波。彩虹市游戏厅内需击败火箭队成员并调查海报进入秘道，最终战胜坂木老大才能取得观测镜这类关键道具。枯叶市电系道馆的垃圾桶机关需要连续触发两个正确开关才能挑战馆主，这种设计模式在多个重要技能获取场景中重复出现。
NPC互动教学构成技能体系的补充要素。常磐森林出口处的格斗家教授百万吨拳击和飞踢，月见山出口旁NPC提供吼叫技能机。正辉恢复人形后会赠送船票以开启圣安奴号剧情线，船长随后给予HM01居合斩。七岛任务线中，完成岛屿间的密码破解可获得特殊技能权限，这种跨区域任务链设计使得技能获取与主线剧情深度绑定。
技能组合需要考虑属性克制与战斗平衡。电系技能十万伏特可通过发电厂事件或代币兑换获取，火系大字爆在百货公司购买，超能系精神干扰则存在于冠军山洞的瀑布区域。地面系地震技能作为终极招式之一，既可在海洋团海底基地深处发现，也能通过高等级拾荒特性精灵极小概率获得。不同属性技能的分布位置呈现出明显的地域特征，与游戏世界观设定形成呼应。
通关后前往一之岛灯火山温泉区域是高效的练级点，火焰山右侧山洞的红宝石能解锁更多岛屿技能点。四岛水怪、三号岛土龙等特殊精灵可针对性提升努力值，配合幸运蛋道具能加速技能培养进程。七岛任务中获取的蓝宝石与仓库密码最终会连通两个地区的技能获取渠道，这种设计延长了技能收集的终局体验。
